1.病毒感染　上呼吸道或腸道病毒感染均可有持續發熱，白細胞數減少，與傷寒相似。但此類病人起病較急，多伴有上呼吸道癥狀，常無緩脈、脾大或玫瑰疹，傷寒的病原與血清學檢查均為陰性，常在1～2周內不藥而愈。

　　2.斑疹傷寒 流行性斑疹傷寒多見于冬春，地方性斑疹傷寒多見夏秋。一般起病較急，脈搏較速，多有明顯頭痛。第5～6病日出現皮疹，數量多且可有出血性皮疹。外斐氏反應陽性。治療后退熱比傷寒為快。

　　3.鉤端螺旋體病 本病的流感傷寒型在夏秋季流行期間常見，起病急，伴畏寒發熱，發熱與傷寒相似。但此病有疫水接觸史，臨床表現有眼結合膜充血，全身酸痛，尤以腓腸肌疼痛與壓痛為著，以及腹股溝淋巴結腫大等；血象白細胞數增高。進行有關病原、血清學檢查即確診。

　　4.急性病毒性肝炎 傷寒并發中毒性肝炎易與病毒性肝炎相混淆，但前肝功能損害較輕，有黃疸者黃疸出現后仍發熱不退，并有傷寒的其它特征性表現，且病原及血清學檢查均為陽性。

　　5.布氏桿菌病 患者有與病畜（牛、羊、豬）接觸史，或有飲用未消毒的乳制品史。本病起病緩慢，發熱多為波浪型，退熱時伴盛汗，并有關節痛或肌痛等癥狀。病程遷延，易于復發。確診須有血液或骨髓培養出病原體、布氏桿菌凝集試驗陽性。

　　6.急性粟粒性肺結核 有時可與傷寒相似，但患者多有結核病史或與結核病患者密切接觸史。發熱不規則，常伴盜汗、脈搏增快、呼吸急促等。發病2周后X線胸片檢查可見雙肺有彌漫的細小粟粒狀病灶。

　　7.敗血癥 少部分敗血癥患者的白細胞計數不增高，可與傷寒混淆。敗血癥多有原發病灶，熱型多不規則，常呈弛張熱、伴寒戰、無相對緩脈。白細胞總數雖可減少，但中性粒細胞升高，血培養可分離出致病菌。

　　8.其它 瘧疾、惡性網狀細胞病、風濕熱以及變應性亞敗血癥等，有時需進行鑒別。