十二指腸潰瘍的主要臨床表現為上腹部疼痛，可為鈍痛、灼痛、脹痛或劇痛，也可表現為僅在饑餓時隱痛不適。典型者表現為輕度或中度劍突下持續性疼痛，可被制酸劑或進食緩解。臨床上約有2/3的疼痛呈節律性：早餐后1～3小時開始出現上腹痛，如不服藥或進食則要持續至午餐后才緩解。食后2～4小時又痛，也須進餐來緩解。約半數患者有午夜痛，病人常可痛醒。節律性疼痛大多持續幾周，隨著緩解數月，可反復發生。

　　十二指腸潰瘍發病有以下特點：①慢性過程呈反復發作，病史可達幾年甚或十幾年。②發作呈周期性，與緩解期相互交替。過去發作期可長達數周或數月，現因有效治療而顯著縮短。緩解期亦可長短不一，短的僅幾周或幾個月，長的可達幾年。③發作有季節性，多在秋冬或冬春之交發病，可因不良精神情緒或解熱鎮痛藥及消炎藥物誘發。④多發于中青年男性。

　　部分病例可無上述典型的疼痛，而僅表現為無規律性較含糊的上腹隱痛不適，伴腹脹、厭食、噯氣等癥狀。隨著病情的發展，可因并發癥的出現而發生癥狀的改變。一般來說，十二指腸潰瘍具有上腹疼痛而部位不很確定的特點。如果疼痛加劇而部位固定，放射至背部，不能被制酸劑緩解，常提示后壁有慢性穿孔；突然發生劇烈腹痛且迅速蔓延及全腹時應考慮有急性穿孔；有突然眩暈者說明可能并發出血。