營養不良性鈣化是指變性、壞死的組織或異物的鈣鹽沉積，較常見。而機體本身并無全身性鈣、磷代謝障礙，血鈣正常。此型鈣化常發生在：結核壞死灶，脂肪壞死灶、動脈粥樣硬化斑塊，玻璃樣變性或粘液樣變性的結締組織，壞死的寄生蟲體、蟲卵及其他異物等。

　　營養不良性鈣化的發生機制尚不清楚。可能與局部堿性磷酸酶升高有關。此酶能水解有機磷酸酯，使局部磷酸超過3Ca2+：2P043-的正常值，所以形成磷酸鈣沉積。至于磷酸酶的來源，一部分是從壞死細胞中的溶酶體釋放出來的。還有一部分可能是吸收了周圍組織液中的磷酸酶。此外，也有人認為，營養不良性鈣化與變性、壞死組織的酸性環境有關。由于鈣鹽在酸性環境中易溶解，使局部鈣離子濃度增高；隨后由于組織液的緩沖，使局部堿性化，導致鈣鹽析出、沉積。