病原學是指專門研究疾病形成的原因的科學。肺結核是結核分枝桿菌引起的慢性肺部感染性疾病，臨床診斷時主要通過結核菌試驗和胸片x線表現等方式進行判斷，除此之外，對此病原學的診斷有利于病情的判斷。具體說來，它包括以下內容：

一、標本采集和結核菌的檢測

標本來源:痰液、超聲霧化導痰、下呼吸道采樣、支氣管沖洗液、支氣管肺泡灌洗液(ＢＡＬＦ)、肺及支氣管活檢標本。痰標本質量好壞,是否停抗結核藥直接影響結核菌檢出陽性結果和培養分離率。晨痰涂片陽性率比較高,當患者痰少時,可采用高滲鹽水超聲霧化導痰。

涂片檢查采用萋－尼抗酸染色和熒光染色法。集菌法陽性率高于直接涂片法。涂片染色陽性只能說明抗酸桿菌存在,不能區分是結核菌還是非結核分支桿菌。由于我國非結核分支桿菌病發病較少,故檢出抗酸桿菌對診斷結核病有極重要的意義。

直接涂片方法簡單、快速,但敏感性不高,應作為常規檢查方法。涂片陰性不能排除肺結核,連續檢查≥3次,可提高其檢出率。 分離培養法靈敏度高于涂片鏡檢法,可直接獲得菌落,便于與非結核分支桿菌鑒別,是結核病診斷金標準。未進行抗結核治療或停藥48～72ｈ的肺結核患者可獲得比較高的分離率。分離培養法采用改良羅氏和ＢＡＣＴＥＣ法,ＢＡＣＴＥＣ法較常規改良羅氏培養法提高初代分離率10%左右,又可鑒別非結核分支桿菌,檢測時間也明顯縮短。

二、結核菌藥物敏感性檢測

肺結核是結核分枝桿菌引起的慢性肺部感染性疾病化學治療3～6個月痰菌仍持續陽性、經治療痰菌減少后又持續增加及復治患者應進行藥物敏感性檢測。原發耐藥率較高地區,有條件時初治肺結核也可行藥物敏感性檢測。目前國內采用絕對濃度間接法,也可采用比例法,濃度完全耐藥時治療效果顯著降低;ＰＺＡ臨床尚未確立公認的有意義的檢查耐藥性方法    

應用BACTEC法進行結核菌藥物敏感試驗,由于采用液體培養基、C14同位素測定結核菌代謝產物判斷生長情況,明顯縮短了檢測時間,其結果與常規的改良羅氏培養基的結果有明顯的一致性,在國內也常被應用。近來為克服放射污染采用了熒光和比色等技術,同樣收到了良好效果。

三、核酸探針技術

痰、ＢＡＬＦ、胸液結核菌聚合酶鏈反應(ＰＣＲ)+探針檢查:由于結核菌生長緩慢,分離培養陽性率不高,需要快速、靈敏和特異的病原學檢查和鑒定技術。核酸探針和ＰＣＲ為結核病細菌學基因診斷提供了可能。ＰＣＲ是選用一對特定的寡核苷酸引物介導的結核菌某特定核酸序列的ＤＮＡ體外擴增技術。它可以在短時間使特定的核酸序列拷貝數增加數百萬倍,在此基礎上進行探針雜交,提高了檢出的靈敏度和特異性。研究結果顯示痰液ＰＣＲ+探針檢測可獲得比涂片鏡檢明顯高的陽性率和略高于培養的陽性率,且省時快速,成為結核病病原學診斷重要參考,但是尚有一些技術問題需進一步解決。

四、血清抗結核抗體檢查

血清學診斷可成為結核病的快速輔助診斷手段,但由于特異性欠強,敏感性較低,尚需進一步研究。 四、菌陰肺結核的診斷定義:菌陰肺結核為三次痰涂片及一次培養陰性的肺結核,其診斷標準為:

1、典型肺結核臨床癥狀和胸部Ｘ線表現。

2、抗結核治療有效。

3、臨床可排除其它非結核性肺部疾患。

4、PPD(5TU)強陽性;血清抗結核抗體陽性。

5、痰結核菌ＰＣＲ+探針檢測呈陽性。

6、肺外組織病理證實結核病變。

7、BALF檢出抗酸分支桿菌。

8、支氣管或肺部組織病理證實結核病變。具備1～6中3項或7～8條中任何1項可確診。