根據消毒因子的適當劑量（濃度）或強度和作用時間對微生物的殺菌能力，可將其分為四個作用水平的消毒方法。

　　1.滅菌  可殺滅一切微生物（包括細菌芽孢）達到滅菌保證水平的方法。屬于此類的方法有：熱力滅菌、電離輻射滅菌、微波滅菌、等離子體滅菌等物理滅菌方法，以及甲醛、戊二醛、環氧乙烷、過氧乙酸、過氧化氫等消毒劑進行滅菌的方法。

　　2.高水平消毒法可以殺滅各種微生物，對細菌芽胞殺滅達到消毒效果的方法。這類消毒方法應能殺滅一切細菌繁殖體（包括結核分枝桿菌）、病毒、真菌及其孢子和絕大多數細菌芽胞。屬于此類的方法有：熱力、電離輻射、微波和紫外線等以及用含氯、二氧化氯、過氧乙酸、過氧化氫、含溴消毒劑、臭氧、二溴海因等甲基乙內酰脲類化合物和一些復配的消毒劑等消毒因子進行消毒的方法。

　　3.中水平消毒法是可以殺滅和去除細菌芽胞以外的各種病原微生物的消毒方法，包括超聲波、碘類消毒劑（碘伏、碘酊等）、醇類、醇類和氯己定的復方，醇類和季銨鹽（包括雙鏈季銨鹽）類化合物的復方、酚類等消毒劑進行消毒的方法。

　　4.低水平消毒法  只能殺滅細菌繁殖體（分枝桿菌除外）和親脂病毒的化學消毒劑和通風換氣、沖洗等機械除菌法。如單鏈季銨鹽類消毒劑（苯扎溴銨等）、雙胍類消毒劑如氯己定、植物類消毒劑和汞、銀、銅等金屬離子消毒劑等進行消毒的方法。