選擇生物安全柜前應考慮：①危險藥物的類型；②可利用空間的大小；③國家有關標準的規定；④環保部門關于有毒物質排放的要求；⑤通風設備的級別等指標。

　　生物安全柜應由專門人員安裝，安裝后應及時驗證其可靠性，以后若有移動或修改也應驗證；即使是在正常使用狀態，也應每隔半年驗證一次。

　　生物安全柜應定期進行消毒、清洗。在進行消毒、清洗操作時，操作者應穿前面封閉的防護衣，戴雙層手套(內層為外科乳膠手套，外層為厚膠皮手套)，戴護目鏡、口罩。先用洗滌劑從上至下，從污染小到污染大的區域逐步清洗，再用去離子水或蒸餾水漂洗干凈，漂洗時紗布應經常更換。污染嚴重的區域(排污槽)應至少用洗滌劑清洗兩遍，收集洗滌、漂洗用水的收集管與排污管的連接處用紗布包裹嚴實，防止污物濺出及含有懸浮粒子的氣體溢出，洗滌劑瓶及漂洗容器一般在操作中污染，所以應始終放在生物安全柜中。清洗之后，所有瓶子、保護性裝置(防護衣、手套、眼罩、口罩)均應當作污染物丟到密封的廢物袋中。

　　生物安全柜應24小時持續開風機。危險藥物的懸浮顆粒和噴濺物通常沉積在工作區中很難吸入高效濾器中，并且生物安全柜的工作區通常為負壓，一旦關掉風機，這些危險物便會污染環境。關掉風機前，必須徹底清洗生物安全柜，然后將其入口及高效濾器的排氣口用塑料覆蓋后用膠帶封住。