在寄生蟲感染中，檢查出寄生蟲病原體是確診的依據。根據臨床診斷提供的線索，通過標本的采集、處理、檢驗、分析等，做出明確結論，為臨床治療和流行病學調查提供可靠的依據。根據寄生蟲的種類、在人體的發育階段和寄生部位的不同可采集相應的標本（糞便、血液、陰道分泌物、尿液、痰液、組織活檢或骨髓穿刺等），采取不同的檢查方法。對于肉眼可見的大部分蠕蟲和節肢動物，根據其標本來源和形態特征可作出初步判斷，如糞便中的蛔蟲、蟯蟲、絳蟲節片、組織中的蠅蛆等；對于原蟲等肉眼無法見到的小型寄生蟲，如阿米巴原蟲、陰道毛滴蟲、瘧原蟲、各種蠕蟲的卵、疥螨、蠕形螨等則須借助顯微鏡觀察。病原體檢查的質量取決于檢驗醫生的責任感和對寄生蟲的形態、生活史、致病等基本知識和基本技能的掌握程度。