像任何縱隔腫瘤一樣，胸腺瘤的臨床癥狀產生于對周圍器官的壓迫和腫瘤本身特有的癥狀，合并綜合征。小的胸腺瘤多無臨床主訴，也不易被發現。腫瘤生長到一定體積時，常有的癥狀是胸痛、胸悶、咳嗽及前胸部不適。

胸痛的性質無特征性，程度不等，部位也不具體，一般講比較輕，常予對癥處理，未做進一步檢查。癥狀遷延時久，部分病人行X線檢查，或某些病人在體查胸透或攝胸片時發現縱隔腫物陰影。

被忽略診斷的胸腺瘤此時常生長到相當大體積，壓迫無各靜脈或上腔靜脈梗阻綜合征的表現。劇烈胸痛，短期內癥狀迅速加重，嚴重刺激性咳嗽，胸腔積液所致呼吸困難，心包積液引起心慌氣短，周身關切骨骼疼痛，均提示惡性胸腺瘤或胸腺癌的可能。

胸腺瘤特有的表現是合并某些綜合征，如重癥肌無力（MG）、單純紅細胞再生障礙性貧血（PRCA）、低球蛋白血癥、腎炎腎病綜合征、類風濕性關節炎、皮肌炎、紅斑狼瘡、巨食管癥等。