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微波是一種波長為1毫米到1米左右的電磁波,頻率較高,可穿透玻璃、塑料薄膜與陶瓷等物質,但不能穿透金屬表面。微波能使介質內雜亂無章的極性分子在微波場的作用下,按波的頻率往返運動,互相沖撞和磨擦而產生熱,介質的溫度可隨之升高,因而在較低的溫度下能起到消毒作用。一般認為其殺菌機理除熱效應以外,還有電磁共振效應,場致力效應等的作用。消毒中常用的微波有2450MHZ與915MHZ兩種。微波照射多用于食品加工。在醫院中可用于檢驗室用品、非金屬器械、無菌病室的食品食具、藥杯及其它用品的消毒。
微波長期照射可引起眼睛的晶狀混濁、睪丸損傷和神經功能紊亂等全身性反應,因此必須關好門后才開始操作。